vasp中linux命令 vasp instructor
安装vasp时,出现如下错误,应该怎么解决,求助
可以考虑使用 KPAR 并行,这个经测试没问题 顺便搜了一下vasp并行策略的问题,根据guan 方的PPT里说的,KPAR是k点并行是最有效率的,NPAR是能带并行次之。
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vasp运行中断,出现unknown怎么回事 检查下你的POSCAR是否有问题。
段错误了,没有运行,只看程序的错误有fin=fopen(pdata,r);没有检查fin的有效性,当打开文件失败时,访问fin会造成段错误,去掉引号中的空格,并检查fin是否有效。
集群上使用的是openmpi,PBS有点问题,所以我一直用命令“mpirun -np 8 vasp”提交任务。不知道如何使用命令进行多节点的并行计算(把一个任务分配到多个节点上)。
POTCAR 将要告诉vasp计算的系统中所包含的各种元素的赝势 pesudopotential,vasp本身就带有比较完善的赝势包,我们需要做的就是选择我们需要具体哪种赝势,然后把相应的文件拷贝形成我们具体的POTCAR文件。我们以GaAs为例。
求助Linux系统下MS5.5和VASP的计算
不知道你是想要vasp的并行安装过程还是vasp的并行执行。 由于知道不能提供文档上传,所以有需要的话可以给我发站内信息。我用邮箱把我自己写的vasp安装过程给你发过去。
如果是集群,还需提交作业的脚本 vasp.job 如下 提交作业 计算结束后, cat out 查看体系是否收敛,如收敛则进入下一步计算。
单从软件上手、使用、分析数据角度,毫无疑问是VASP更方便,但是ASTEP(Linux)现在学术免费,可以向guan 方申请得到的比较新的版本(CASTEP19),而MS-CASTEP据我所知里面的CASTEP模块是比较老的版本(具体哪个版本不确定)。
Linux系统中aaa-vasp.sh是什么意思
linux中.sh文件是脚本文件,一般都是bash脚本。脚本文件英文为Script。实际上脚本就是程序,一般都是由应用程序提供的编程语言。
sh命令是shell命令语言解释器,执行命令从标准输入读取或从一个文件中读取。通过用户输入命令,和内核进行沟通!Bourne Again Shell (即bash)是自由软件基金会(GNU)开发的一个Shell,它是Linux系统中一个默认的Shell。
sh是linux中运行shell的命令,是shell的解释器,shell脚本是linux中壳层与命令行界面,用户可以在shell脚本输入命令来执行各种各样的任务。
sh或是执行脚本,或是切换到sh这个bash里,默认的shell是bash,你可以试试tcsh啊,csh啊,ksh,zsh什么的,看看别的shell是什么样子的。当然,linux中sh是链接到bash上的,所以sh与bash在功能上是没有区别的。
因为ip.sh是个脚本,所在的位置,并没有加到PATH这个环境变量里。所以运行时,系统搜不到这个命令,要执行:./ip.sh 告诉系统这个脚本在当前目录下。
第一行的“#! /bin/sh”不要少。有了这行定义,系统就知道你写的是一个shell脚本,另外你的脚本缺少可执行权限,需要使用chmod +x aaa.sh命令将可执行权限添加上去,这样,就可以使用./aaa.sh来执行这个脚本了。
vasp运行中断,出现unknown怎么回事
1、出现这种情况一般从硬件和软件两个方面考虑,硬件方面主要发生在内存上,软件方面则有可能是电脑中病毒了,收到了病毒程序的干扰,或是安装了一些与自身电脑不兼容的软件等。
2、应该是内存不足,没有写入EIGENVAL文件 不过也没有关系,实际上此时的能量本征值都写入了OUTCAR了。也很容易从这儿提取能带的信息。
3、unknown software exception (0x*00000**),位置为0x0***0 这个问题大多是杀毒残留,但也有可能是你卸载某个软件不正确留下的注册表残留。
4、散一般出现这个现象有方面的,一是硬件,即内存方面有问题,二是软件,这就有多方面的问题了。
5、在“开始”菜单里面点“运行”输入“cmd”,对电脑进行调试,具体步骤如下。首先将usb设备插入计算机接口,然后在桌面左下角单击“开始”菜单,单击“运行”命令,打开框中键入“cmd”命令,单击“确定”按钮。
6、解决方法 步骤一:停用 USB 0 控制器 根据不同的操作系统做以下操作:在 Windows 2000 Pro 操作系统中,依次点击“开始”→“控制面板”→“系统”。
求助一个关于Linux下的VASP故障的问题
1、ERROR FEXCF: supplied exchange-correlation table is too small, maximal index : 912695 这个问题是由于intel编译器的问题,(我猜)天河上用intel可能是2013 or 2015。
2、用VASP DFT计算能带时我需要考虑自旋轨道耦合(SOC)我的问题如下:(1)计算时,在INCAR中加入SOC的参数,是考虑在SCF自洽时加,还是在 band计算加入。
3、VASP程序用多了,经常目录下会留下不少的WAVECAR,CHGCAR等文件。如果不用的话,占用很大的磁盘空间。
4、请教一下大家一些问题,我用的软件是VASP:首先对于吸附计算来说,一开始要进行吸附材料的结构优化计算。
虚拟机下的linux安装VASP可行么
1、redhat4 可以直接su 然后输入你装系统设置的密码,进到root下。
2、装VASP运行肯定是可以的,只是计算稍大点的体系速度就慢得要命了,你可以直接装linux系统或是装虚拟机的linux系统。完成某个独立任务的程序及其所需的数据组成一个作业。
3、启动Windows 10操作系统,点击任务栏开始按钮,弹出开始菜单选择VMware→VMware Workstation项。唤出VMware Workstation 10程序窗口。点击创建新的虚拟机图标,通过虚拟机安装操系统。
4、linux下的可执行图标和shell终端图标很像 E、到/usr/bin目录里找安装的软件启动文件执行命令。
5、下载一个redhat,因为redhat已经商业化了,推荐大家使用centos,如果自己有合适的linux安装版本,可以不使用这个。
6、用户可以通过vmware、virtualbox等虚拟机来安装linux系统。使用虚拟机来安装linux主要分为两步,第一步是创建虚拟机,第二步是安装系统,接下来以virtualbox安装centos为例来简要说明安装步骤,仅供参考。
文章名称:vasp中linux命令 vasp instructor
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